【文献】多发性骨髓瘤细胞骨髓微环境单细胞图谱

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       本年更博主终于更新了，今天在journal club上讲了发表在Nature Immunology上来自荷兰伊拉斯姆斯大学医学中心的多发性骨髓瘤微环境的单细胞图谱分析的研究，这篇文章蛮不错，特别记录一下：

【背景】多发性骨髓瘤是一种血液癌症，和plasma细胞的异常增殖有关。在发病的早期，一般没有明显症状。在发病后期，会出现骨头疼痛、贫血、易感染等症状。

一、骨髓微环境的基质细胞图谱

1.实验设计：13名病人，7名年龄匹配的非癌症患者

值得注意的是，骨髓微环境中基质细胞的比例非常低：约为0.002%。

2.骨髓微环境的单细胞图谱，通过使用Seurat分析，聚类分析后有八个亚类的细胞

3.其中MSC1和MSC2两个亚类的细胞的多发性骨髓瘤病人中大量扩增

4. GSEA分析发现这两群MSC1和MSC2的TNFA-signaling via NF-κB通路上调，相关炎症基因表达上调

5. 炎症相关基因在MSC1/MSC2中高表达，使用UMAP绘制了相关基因的表达，并使用ELISA检测了plasma中相关基因的蛋白表达水平, 命名MM病人特异MSC1和MSC2为炎症间质细胞(iMSC) - KEY FINDING

6. 使用STRING共表达分析，再次确定相关炎症基因在TNF/IL-1B相关pathway中高相关性，并检测了IL-1B在血清中的含量，TNF未检测到

二、TNF和IL-1B的来源

为了研究TNF和IL-1B的来源，作者先对4个额外收集的病人进行了分析，发现TNF主要来源于Lymphocytes, IL-1B主要来源于Myeloid. 

三、骨髓微环境的免疫细胞图谱

1. 实验设计：和基质图谱相同的13名病人, 5名非癌症病人，分别分选了CD38-, CD38+ (包括immune cell和myeloma cell)

2. CD38-免疫细胞单细胞图谱，FOXP3 Treg细胞在病人中下降，INF-reponse T细胞在病人中上升(重要）

3. CD38+ 免疫细胞单细胞图谱（除myeloma cell), CD8+ Tscm和NK细胞值得关注

4. CD38+ Myeloma细胞单细胞图谱，7个亚群，均高表达SDC1, TNF和IL-1B几乎不表达(UMAP) - 和文献已报道结果不一致

5. 在CD38-和CD38+免疫细胞中对TNF/IL-1B进行了全局比较，发现INF-reponse T和GZMB+CX3CR1 NK等细胞中TNF高表达

四、经过治疗的病人的间质细胞依然处于炎症环境

1. 实验设计：在bulk分析的14个病人中，有9个病人有疾病检测时和4*28疗程以后的前后两个时间点的匹配数据，对这两个时间点的进行bulk RNAseq分析

2. 发现这些病人在治疗以后，其间质细胞中炎症相关基因依然高表达

总结一下

往期回顾

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